O Centro de Educação Física e Desportos (CEFD) surgiu do antigo Centro Esportivo Universitário (CEU), que foi criado para que a comunidade acadêmica e santa-mariense pudesse usufruir de atividades esportivas e de lazer, beneficiando a saúde de todos. Com a reforma do ensino superior, ocorrida em 1968, decidiu-se integrar ao CEU um curso de graduação.
Para receber a Faculdade Superior de Educação Física, o projeto tomou um rumo diferente, adequando as instalações à rotina acadêmica. Na sequência, houve a divisão da Universidade em centros e adicionou-se a palavra “Desportos” a este, renomeando-o de Centro de Educação Física (CEF) para Centro de Educação Física e Desportos (CEFD), o qual se departamentalizou em Departamento de Educação Física e Departamento de Desporto Universitário. Nesse momento, foi criada a Associação Desportiva da Universidade Federal de Santa Maria (ADUFSM).
Atualmente, o CEFD conta com 3 cursos de graduação, 3 de pós-graduação e 3 departamentos.